Reproduserbarhet i bioinformatikk: Et case study av batch-korrigeringsverktøyet ComBat

Abstract

Reproduserbarhet er et viktig prinsipp i den vitenskapelige metoden. I den siste tiden har mengden med ureproduserbar forskning økt. Forskere ved avdeling for Biomedisinsk Forskning ved Universitetet i Oslo har nylig avslørt urovekkende elementer ved et mye brukt statistisk verktøy, ComBat. Oppgaven går ut på å undersøke hvorvidt ComBat har ført til upålitelige resultater i forskning. Metoden som er brukt er artikkel analyse, og å kontakte forfattere direkte. Resultatene viste at hoveddelen av forskning som siterte bruk av ComBat ikke spesifiserte tilstrekkelige detaljer for reprodusering av forsøket.