Gene expression analysis in DLBCL; Identification and characterization of novel proteins

Abstract

Follicular lymphoma (FL) represents the most common low-grade Non-Hodgkin’s lymphoma. FLs are of B cell origin, generally incurable, and frequently transform to high-grade diffuse large B cell lymphoma (DLBCL). Transformation is generally correlated with poor prognosis and the molecular mechanisms involved are largely unknown. The present study aimed at the identification of novel genes that were differentially expressed in patient-matched biopsies of FL and DLBCL to increase the understanding of disease progression.<br>

Application of the subtraction methodology cDNA Representational Difference Analysis (cDNA RDA) on lymphoma biopsies identified 92 differentially expressed genes. Of these, two novel genes were characterized: the Immunoglobulin-like domain containing receptor 1 gene (ILDR1) and the centrosome/spindle pole-associated protein 1 gene (CSPP1). ILDR1 encodes three isoforms and upon examination of a limited set of biopsies, one of the isoforms showed a lymphoma-associated expression. Over-expression of CSPP disturbs spindle assembly and impairs progression through the G1/S phase of the cell cycle. A correlation between CSPP1 mRNA over-expression and poor prognosis in a larger set of de novo DLBCLs in conjunction with the mitotic defects observed upon over-expression in vitro, suggests that CSPP is involved in cell-cycle control and cancer development/progression. A novel gene family, the family with sequence similarity 110 (FAM110), consisting of members A, B, and C were identified as potential interaction partners to CSPP. Also these proteins associate with centrosomes and spindle poles and arrest cells in the G1 phase upon over-expression, thereby indicating a role in cell-cycle control. Furthermore, FAM110C localizes to the microtubule cytoskeleton, and depletion of this protein impairs cell spreading and migration of epithelial cells.

Gener involvert i utvikling av lymfeknutekreft<br><br>

Cand.scient Helena Hauge har undersøkt lymfeknutekreft (B celle lymfom) og karakterisert to hittil ubeskrevne gener og en genfamilie som kan være involvert i utviklingen av denne sykdommen. <br>

Rundt 150 personer i Norge får årlig diagnosen follikulært B-celle lymfom, en kreftform med utspring i immunsystemet som opptrer i lymfeknutene. Denne kreftformen er generelt vanskelig å helbrede og utvikler seg ofte til en mer aggressiv krefttype, diffust storcellet B-celle lymfom. De genetiske endringene som ligger til grunn for denne videreutviklingen er lite kjent.<br>

I sin avhandling ”Gene expression analysis in DLBCL; Identification and characterization of novel proteins.” har Helena Hauge og medarbeidere sett etter forskjeller i genuttrykk i pasientmateriale hentet fra det aggressive stadiet sammenlignet med det lav-gradige stadiet, for å forstå de biologiske prosessene som fører til sykdomsforverring. To hittil ubeskrevne gener og en genfamilie med assosiasjon til B-celle kreft og dens utvikling ble funnet og beskrevet i studien. Dette har resultert i publikasjoner i internasjonalt anerkjente fagtidskrifter. Et av de nybeskrevne genene, CSPP1, viser seg å være involvert i kontroll av celledeling. Overuttrykk av dette genet fører til feilfordeling av kromosomer. Dette er et kjent fenomen i høy-gradig kreft og generelt forbundet med dårlig sykdomsprognose. Foreløpige resultater viser at det er en sammenheng mellom overuttrykk av dette genet og kortere overlevelse for pasientene. En ny genfamilie, FAM110, som ble identifisert gjennom arbeidet med CSPP1, er også beskrevet. Resultatene tyder på at også disse genene kan være viktige for kontroll av celledeling. I tillegg er de involvert i vandring av celler. Både ukontrollert celledeling og økt vandring er egenskaper som ofte karakteriserer kreftceller.