Hide metadata

dc.date.accessioned2013-03-12T08:52:57Z
dc.date.available2013-03-12T08:52:57Z
dc.date.issued2004en_US
dc.date.submitted2004-11-01en_US
dc.identifier.citationBremer, Sara. IMPDH type I og II ekspresjon i blodceller: Utvikling, validering og etablering av relativ kvantitativ RT-PCR analyse. Hovedoppgave, University of Oslo, 2004en_US
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10852/12073
dc.description.abstractMykofenolat mofetil (MMF) (CellCept®) brukes etter transplantasjoner for å hindre avstøtning av det transplanterte organet. MMF er et prodrug som raskt omdannes til mykofenolat (MPA). MPA hemmer inosin-5`-monofosfatdehydrogenase (IMPDH) som katalyserer det hastighetsbestemmende trinnet i nysyntesen av guaninnukleotider. Virkningsmekanismen skyldes trolig hovedsakelig hemmet lymfocyttproliferasjon. Det har ennå ikke blitt etablert et terapeutisk område for plasmakonsentrasjonen av mykofenolat. Til tross for store inter- og intraindividuelle farmakokinetiske variasjoner, doseres MMF vanligvis i faste doser på 1 gram to ganger daglig. Analyser av fullblodcellelysat har vist at den basale aktiviteten av IMPDH øker i den første tiden etter transplantasjon hos nyretransplanterte som blir behandlet med MMF. Endringer i MPA-plasmakonsentrasjonen ble raskt etterfulgt av inverse endringer i IMPDHenzymaktiviteten.Til tross for at den basale enzymaktiviteten, målt rett før MMF dose (C0),økte utover i forløpet, ble den tilnærmet totalt hemmet når plasmakonsentrasjonen av MPA var på topp (Cmax). Det finnes to isoformer av enzymet, IMPDH I og IMPDH II. Enzymaktivitetsanalysen skiller ikke mellom disse. Dersom økningen i IMPDH-aktivitet skyldes økt proteinsyntese, vil også mRNA-nivåene for IMPDH I og/eller IMPDH II være økt. I dette delprosjektet har vi etablert en metode for spesifikk kvantitativ analyse av mRNA for IMPDH I og IMPDH II ved hjelp av relativ sanntids kvantitativ RT-PCR. Denne teknologien var ikke etablert på laboratoriet der hovedfagsarbeidet er utført, så de ulike metoder og teknologier som er nødvendige ble etablert. Ulike metoder for RNA-stabilisering for analyse av IMPDH-ekspresjon i fullblod ble sammenlignet. Det viste seg at prøveglass som inneholdt en saltløsning med kationiske detergenter (PAXgene ) egnet seg best for prøvetaking og umiddelbar stabilisering av RNA i fullblodprøver. For isolering av CD4-positive lymfocytter ble det brukt magnetiske kuler med antistoff mot CD4-markøren. RNA fra disse cellene ble deretter stabilisert ved lysering av cellene med Lysis/binding buffer. Total-RNA ble isolert fra prøvene ved hjelp av MagNA Pure LC . cDNA-syntesen ble gjort i et separat trinn med heksamere primere med tilfeldig (blandet) nukleotidrekkefølge. Deretter ble cDNAtemplatene amplifisert i LightCycler . Dette instrumentet kan detektere amplifikasjonsproduktene underveis i polymerasekjedereaksjonen (PCR), og prosessen benevnes sanntids PCR. Det ble benyttet spesifikke hybridiseringsprober for hvert av genene til deteksjonen. Kvantifiseringen ble gjort relativt i forhold til ekspresjonen av referansegenene ALAS og G6PDH. Prøvene ble normalisert i forhold til en kalibrator som ble tatt med i hver kjøring. I tillegg ble det benyttet en funksjon i programvaren (LightCycler Relative Quantification) som korrigerer for konsentrasjonsavhengige forskjeller i PCReffektiviteten for de aktuelle genene. Metoden ble validert med hensyn til spesifisitet, sensitivitet, deteksjonsgrense, innen-serie og mellom-seriepresisjon og linearitet. Dette ble blant annet gjort ved PCR-analyse av seriefortynninger, gelelektroforese, smeltepunktsanalyse og sekvensering av PCR produkt. Fire pasienter ble fulgt med gjentatte prøver før transplantasjon og start av MPA-behandling og i inntil to måneder etter. Prøver med lysert fullblod (PAXgene ) ble analysert med den etablerte metoden. Foreløpige analyser viser at det er store variasjoner i mRNA for IMPDH I etter start av MPAbehandling. Ekspresjonen økte hos tre av fire pasienter. Det var tendenser til reduksjon i mRNA nivået for IMPDH II. Analysemetoden kan bidra til å gi økt kunnskap om MPA sin virkning på IMPDH. Dette vil være nyttig i forbindelse med utvikling av en egnet strategi for farmakologisk monitorering og individualisering av MPA-behandling. I tillegg vil det kunne utvide den generelle kunnskapen om hvordan immunsuppressiva virker. For pasienten vil dette igjen kunne resultere i en behandling med færre bivirkninger og redusert risiko for rejeksjoner.nor
dc.language.isonoben_US
dc.subjectinosinmonofosfat dehydrogenase mRNA reverstranskriptase mykofenolat sanntids PCR LightCycler MagnaPure IMPDHen_US
dc.titleIMPDH type I og II ekspresjon i blodceller: Utvikling, validering og etablering av relativ kvantitativ RT-PCR analyse : Ekspresjonsendringer hos nyretransplanterte under mykofenolatbehandlingen_US
dc.typeMaster thesisen_US
dc.date.updated2005-12-07en_US
dc.creator.authorBremer, Saraen_US
dc.subject.nsiVDP::568en_US
dc.identifier.bibliographiccitationinfo:ofi/fmt:kev:mtx:ctx&ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:dissertation&rft.au=Bremer, Sara&rft.title=IMPDH type I og II ekspresjon i blodceller: Utvikling, validering og etablering av relativ kvantitativ RT-PCR analyse&rft.inst=University of Oslo&rft.date=2004&rft.degree=Hovedoppgaveen_US
dc.identifier.urnURN:NBN:no-11409en_US
dc.type.documentHovedoppgaveen_US
dc.identifier.duo21913en_US
dc.contributor.supervisorStein Bergan, Helge Rootwelt, Anders Åsberg, Hege Christensenen_US
dc.identifier.bibsys042138302en_US


Files in this item

FilesSizeFormatView

No file.

Appears in the following Collection

Hide metadata